ゲームを起動したとき逆向きに画面が表示されること、ありませんか？
画面自動回転機能をオフにしていても、起動時に一瞬だけ画面の向きをセンサーで見ているのかもしれませんね。
その場合、タスクキルしてゲームを再起動するとか・タイトル画面に戻るとかすると思いますが、それだと少し時間がかかりますよね。
一番早い対処法としては、オプションを表示するだけで元に戻せます。
オプションを表示するときに画面の向きを初期化しているのでしょう。
ちなみに、画面自動回転機能はオフにしておく方がオススメです。
オンにしておいた場合、ジャイロセンサーが常時働いているはずで、電池消費量が早くなるためです(*'ω')ﾉﾞ